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Ces eaux sombres, encaissées dans des caps rocheux qui plongent aussi profondément, donnent au fjord du Saguenay un air de mystère. On ne peut sempêcher de se demander ce qui peut bien se cacher dans ces eaux noires.
Pourtant si calme en surface, le fjord du Saguenay regorge de vie marine, comme des invertébrés marins et des poissons, mais cette faune se fait très discrète pour l’observateur en surface. Les seuls animaux qui vivent à la fois sous l’eau et qui apparaissent à la surface, le temps de respirer, pour se reposer ou pour socialiser entre eux, sont les mammifères marins.
Les caractéristiques hydrologiques du fjord rendent possible le voisinage d'espèces dulcicoles et marines dans le même cours d'eau. Des frontières bien déterminées par la salinité et la température de l'eau leur permettent de vivre séparément les unes des autres.
Parmi les fjords du monde, on peut considérer le nôtre comme étant d'une très grande richesse biologique grâce à l’entrée d’eau provenant régulièrement de l’estuaire du Saint-Laurent à marée haute. Cette grande biodiversité et ces conditions écologiques particulières en font un milieu naturel regorgeant de vie marine unique au monde.
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